過去のイベントについてご案内いたします。
Category | その他 |
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Date and Time | 2016-11-08 15:30 - 18:00 |
Venue | Auditorium C1F |
Affiliation | |
Title | テクニカルセミナー: 10XGenomics社Chromiumシステムを用いた ハイスループットシングルセルRNA-seqと ロングレンジゲノム解析 |
Poster | click here to download(PDF) |
Host | Shigehiro Kuraku |
Summary | 10X Genomics社Chromiumシステムは、分子バーコードとマイクロエマルジョン作成技術を利用するイルミナ社NGS用の前処理装置です。 シングルセルからNGSライブラリーを調整する際に、細胞毎に異なる分子バーコードを付加することで、数千~数万細胞のシングルセルRNA-seqを実現しました。集団を構成する個々の細胞の発現プロファイルの解析だけでなく、割合が1%以下のレアな細胞の解析も可能です。 ゲノム/エクソン解析では、ショートリードの情報から、ハプロタイプ毎に分けられた切れ目の無い配列情報(phase block)を得ることができ、数10MBのphase blockから、これまで難しかった大きな構造変異(欠失、挿入、転座、融合、など)を解析できます。 本セミナーでは、技術的な説明とあわせて解析例をご紹介させて頂きます。 |